《仙剑奇侠传九野》作为一款创新的对战卡牌游戏，有着其独特的战斗机制。游戏的主要战斗方式为回合制，每个回合需要经历布阵和结算两个阶段。在布阵阶段，双方玩家需要同时放下牌，然后切换到结算阶段，根据牌的结算顺序计算伤害。
布阵界面
游戏开始后，玩家的操作都在布阵界面上进行。
①玩家手牌。这里会简略显示每张牌的卡图、灵力消耗和生物牌的攻击和生命
②剩余灵力/当前灵力最大值。默认情况下，开局时的灵力最大值只有1点，会随着回合数的增加而增加，最多为10点。
③开始按钮。布阵完毕后点击此处，进入结算阶段。
④我方状况。从左到右依次为手牌数、牌库数、弃牌数。其中手牌为画面下方显示的，玩家已抓到的牌；牌库指玩家进入战斗前所组的卡组；已上场的卡牌被击败或使用完毕后就会被放入弃牌区中。
⑤我方阵地。共有6个格子，分别标记了甲、乙、丙、丁、戊、己，卡牌结算时也将按照这个顺序进行。
⑥我方生命。我方英雄的生命值，降至0时我方判输。
⑦回合数。
⑧敌方情报。在这里会显示敌方的一切信息，包含生命值、灵力、卡牌状况和英雄技能的冷却剩余回合数。
⑨撤回按钮。布阵失误时可点击此键返回上一步。
⑩英雄绝技。左下角为绝技冷却剩余回合数，冷却完毕后点击此键使用绝技。
布阵阶段
布阵阶段顾名思义，就是让玩家放牌的阶段。如图所示，画面左侧标有“敌阵”的为敌方阵营，右侧标有“本阵”的则为我方阵营。
我方仅能在右侧“本阵”区域进行放牌。
部署的限制
玩家最多可部署6张牌，且牌的灵力消耗总计不能超过当前的灵力最大值。每张牌的左上角蓝色数字即为要消耗的灵力。
部署
玩家的场地共有6个格子可供部署，选择牌后点击己方场上的空位或拖动至空位即可完成部署操作。若想在已有牌的位置部署新的牌，则需要将原有的牌推挤到邻近一格。注意，这个操作会影响已有牌的结算顺序。
绝技
玩家除了放牌外，还可以点击左下方的绝技按钮使用英雄绝技，释放英雄绝技也需消耗灵力。不同英雄之间的技能效果不同，而且开战后的冷却时间（画面左下角的数字）也因英雄而异。
结算阶段
玩家完成布牌后，点击画面右下方的“开始”按钮进入结算阶段。结算阶段无需任何操作，玩家只需要观看卡牌之间的相互搏斗即可，但还是要注意以下几点。
战斗阶段有既定的结算顺序，卡牌翻开后就会被召唤至场地上。
结算顺序
双方的卡牌结算严格按照甲、乙、丙、丁、戊、己的格子顺序同时计算，若该回合有使用英雄绝技的情况，则优先处理英雄绝技的效果。
结算规则
结算时，若该格子为盖牌则会翻开。生物牌在翻开的回合不会发动攻击（但能被攻击），法术牌则会立即结算效果；若是已存在的生物牌就会进入战斗步骤，该生物会主动攻击同列（召唤场景中甲丁、乙戊 、丁己为同列）最近的敌方生物，若同列无敌人（盖牌不视作敌方单位）则会直接对敌方英雄造成伤害。
伤害判定
双方生物进入战斗步骤时，就要进行伤害判定，双方的生物会相互承受彼此攻击数值的伤害，生命为0及以下的生物会被消灭。
