虽然有人发过了，但是条件没有很清楚，所以在这里给出已知的详细条件吧（剧情自动出现的没有列出，请注意）。全部地点都需要通过无限笛子的飞行模式才能去到，笛子会在捕捉了固拉多（红宝石）/盖欧卡（蓝宝石）之后就能获得，然后打完第8道馆之后去博士那里升级全国图鉴就可以去找这些神兽。
部分神兽出现条件的所需精灵可以是没有卡标的，部分有组合的神兽（如神奥的三圣菇）每次是只随机出现一只，想要捕捉另一只就要等明天。出现的神兽的等级一律是50。由于在飞行模式中不能存档，所以想刷性格的人请在附近降落存档后再进入指定地点。
成都的3圣兽（炎帝、水君、雷公）
条件：手持凤凰或者洛基亚。
地点：橙华森林的右边的叫未知の森
帝牙盧卡（蓝宝石限定）/帕路奇犽（红宝石限定）
条件：手持三圣菇
地点：在第2道馆附近的次元裂缝
骑拉帝纳
条件：手持帝牙盧卡和帕路奇犽（两只都要）
地点：第2道馆附近的次元裂缝
伊修地方的3剑客
条件：手持3只努力值已经满了的精灵
地点：暮水镇附近的平原，那块平原上会有一个小红点
龍捲雲（红宝石限定）/雷电云（蓝宝石限定）
条件：手持漂浮泡泡
地点：第6道馆附近的黑云
土地云
条件：手持龙卷云和雷电云
地点：第6道馆附近的黑云
雷希拉姆（红宝石限定）/捷克罗姆（蓝宝石限定）
条件：手持高等级的精灵，具体等级不明……大概是70~80以上。
地点：110号道路右边的小岛的红点
酋雷姆
条件：手持雷希拉姆和捷克罗姆
地点：离116号道路最近的烟凸山附近的红点
克雷色利亚
条件：没有
地点：离彩幽市（联盟）最近的小岛的红点（暂时像是只限周日出现）
凤凰（红宝石限定）/洛基亚（蓝宝石限定）
条件：在原.废弃船里获得探测器（需要潜水技能），拿给在凯那市坐船的那里的馆长，然后他会给你捉凤凰/洛基亚所需要的道具
地点：在原.废弃船的潜水区域的底下2层
神奥的三圣菇
条件：手持3只亲密度满了的精灵
地点：暂时不明……
部分地点由于已经捕获了神兽，暂时无法确认准确地点，会尽快确认且补上。请体谅……
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